Podstawową zasadą działania fotodepilacji lasera IPL-a jest zjawisko selektywnej fototermolizy.Polega ono na tym, że podczas zabiegu fotoepilacji światło lasera przenika przez skórę i jest absorbowane przez melaninę (barwnik włosa). Pochłonięta przez melaninę energia świetlna jest zamieniana na energię cieplną, która powoduje zniszczenie opuszki włosa i koagulację naczyń krwionośnych odżywiających macierz włosa. Dzięki temu po zabiegu następuje całkowite usunięcie włosa oraz zablokowanie procesu formowania się nowego mieszka włosowego.Przy zabiegu usuwania owłosienia laserem istotną rolę odgrywa cykl wzrostu włosa. Faza wzrostu (anagen) – włos osiąga swoją pełną długość, cebulka jest otwarta, a odżywianie odbywa się przez brodawkę połączoną z krwiobiegiem. Właśnie ta faza jest idealna do wykonania zabiegu. Kolejny etap w życiu włosa to faza przejściowa (catagen) – włos uwalnia się z brodawki i przesuwa do góry. Następuje zatrzymanie procesów rozrodczych zachodzących we włosie. Nadchodzi faza spoczynku (telogen) – włos najpierw jest odżywianyz mieszka, a potem powoli martwieje i wypada.Faza ta ma różny czas trwania, od 3 do 8 tygodni. Zabieg przeprowadzony w tym czasie nie jest skuteczny. Ponieważ nie wszystkie włosy rosną równocześnie, na danym obszarze ciała mamy do czynienia z różnymi fazami. Musimy więc pamiętać o tym, że usuwanie owłosienia nie może się odbywać jednorazowo. Ważne jest, aby każdy włos został usunięty w fazie wzrostu, ponieważ trzeba mieć pewność, że zniszczone zostały wszystkie komórki zarodkowe oraz brodawki – tylko wtedy mamy gwarancję, że włos nie odrośnie.

Po jednorazowej fotoepilacji obserwuje się utratę włosów do 30 proc. dlatego konieczne jest przeprowadzenie serii zabiegów: 4–8 zabiegów w odpowiednich odstępach czasowych, średnio co 4–8 tygodni, co naturalnie jest uzależnione od miejsca wykonywania zabiegu i indywidualnych predyspozycji pacjenta.